Стеблевая головня зарегистрирована небольшими очагами в Азербайджане, Грузии, Туркмении, Узбекистане, Киргизии, и в Ставропольском крае и Крыму.
На стеблях, листьях и влагалищах пораженных растений образуются продольные, слегка выпуклые полосы длиной от 2—3 мм до нескольких сантиметров. Сначала они светлее тканей растений, а позже темнеют и приобретают свинцово-серую окраску. При подсыхании эпидермиса полосы растрескиваются и обнажается темная масса телиоспор. Больные растения отстают в росте, часто вместо колоса образуется скрученная масса пораженных тканей, вследствие чего урожай зерна практически не получают.
Возбудитель болезни — базидиальный гриб Urocystis tritici Koern. Его телиоспоры собраны в клубочки округлой, эллипсоидальной или продолговатой формы, размером 20—45 X 12—38 мкм. Состоят они из 1—8 центральных (плодущих) спор, окруженных 5—20 периферическими (бесплодными). Первые — шаровидные или эллипсоидальные, коричнево-бурые, размером 6— 20 X 8—17 мкм, вторые имеют такую же форму, но светло-желтые, размером 5—17 X 4—8 мкм. Телиоспоры прорастают после месячного покоя. Из них образуются одноклеточные базидии, на вершине которых находится веночек из 2—6 цилиндрических базидиоспор. Не отделяясь от базидий, базидиоспоры прорастают, и инфекционные гифы заражают проростки пшеницы. Заражение пшеницы может происходить до появления у нее первого листа.
Стеблевая головня (возб. Urocystis tritici Koern): 1 — пораженное растение; 2 — пораженная часть стебля; 3 — телиоспоры; 4 — проросшие телиоспоры и образование базидии с базидиоспорами.
Исследованиями отечественных ученых установлено, что заражение пшеницы возбудителем стеблевой головни происходит при влажности выше 60% и температуре почвы от 5,9 до 15,4°, однако, по данным иностранных авторов, оптимальная температура для заражения растений находится в пределах 19—21°.
В природных условиях телиоспоры сохраняют свою жизнеспособность в почве не более года. Основным источником инфекции является заспоренное зерно.
Вследствие поражения стеблевой головней замедляется рост растений, листьев образуется меньше и они мелкие, снижается продуктивная кустистость. Урожаи вегетативной массы пораженных растений приблизительно в 5 раз меньше, чем здоровых. Недобор урожая зерна почти соответствует проценту поражения растений.